phpmotionの設置を階層にした場合、

php phpmotion

phpmotionの設置を階層にした場合、.htaccessの修正も必要ですが
動画アップ時のCGI連携のために以下のサイト様のように変更が必要です。

http://aglas.blog38.fc2.com/blog-entry-9.html

/cgi-bin/uu_default_config.pm
/cgi-bin/audio/uu_default_config.pm
　　　　　↓
temp_dir => $ENV{'DOCUMENT_ROOT'} . '/****/temp/',
upload_dir => $ENV{'DOCUMENT_ROOT'} . '/****/uploads/avi/',
redirect_url => '/****/uploader_finished.php',
path_to_upload => '/****/uploads/avi/',

uploader_conlib.php
audio_uploader_conlib.php
　　　　　↓
$path_to_upload_script = '/****/cgi-bin/uu_upload.pl';
$path_to_ini_status_script = '/****/cgi-bin/uu_ini_status.pl';

多謝